Amar est chargé d'enquêter sur une affaire de meurtres en série. En enquêtant sur l'affaire, il se rend compte que les choses ne sont pas ce qu'elles semblent être et que suivre cette voie ne mènera qu'à une guerre entre toutes les personnes impliquées.
Après avoir réalisé le danger d'une arme biologique, un scientifique veut la protéger contre toute utilisation abusive. Le flacon atteint accidentellement l'Inde et il doit courir contre le temps pour éviter une catastrophe potentielle.
Ponnar Shankar est basé sur un roman historique écrit par Kalangir M. Karunanidhi. L'histoire est celle de deux guerriers, deux frères nommés Ponner et Sankar vivant à Kongu Nadu (aujourd'hui Coimbatore, Erode etc.). Il s'agit d'un film historique et ces deux guerriers sont même vénérés...