En entendant parler de l'histoire de l'île au trésor, Nobita rêve de découvrir et d'explorer sa propre île au trésor, malgré le fait que toute la Terre a déjà été cartographiée.
Au XVIIIème siècle, à Port d'Espagne, une île des Caraïbes, le pirate Long John Silver est à la recherche de l'emplacement d'un trésor, décrit sur le médaillon que le défunt capitaine Flint a donné avant de mourir au jeune Jim Hawkins. Ce dernier a été enlevé par Mendoza, un pirate...
En 1803, sur les côtes des Cornouailles, Le Kid, un gamin de quinze ans, s'échappe de l'orphelinat où il vivait comme un bagnard. Il ignore son vrai nom et a pour seule richesse la carte d'une île au trésor tombée du livre de Black Mór, un célèbre pirate auquel il souhaiterait ressembler....
