Akihabara@DEEP raconte l'histoire de cinq otaku qui quittent la société pour finalement fonder leur propre entreprise informatique appelée Crook. Mais Nakagomi, président d'une société électronique influente appelée Digital Capital, fera tout pour mettre la main sur Crook
Deux actrices colocataires aux personnalités très différentes passent une audition pour le même rôle. Une fois revenues à l'appartement, la tension s'installe et la rivalité l'emporte...
